消毒土壤：对苗床土壤、覆土或其他覆盖设施进行消毒，同时种子用恶毒灵进行拌种。
管理措施：施加腐熟农家肥，控制好苗床温度，连阴转晴时及时通风。苗期时，可喷施0.1-0.2%磷酸二氢钾，发现病株后及时拔除。
用药：发病初期，叶面喷施40%甲基硫菌灵悬浮剂500倍液或5%井冈霉素水剂1500倍液、15%恶霉灵水剂450倍液，7天/次，连喷2次。
一、防治辣椒立枯病的方法
1、发病症状
感病后，主要是在茎基部出现带有同心轮纹的深褐色病斑。病斑会逐渐扩大腐烂，直到茎部皮层烂掉出现木质部，病部出现萎缩植株死亡，但是却不会断裂倒伏呈现保持直立的枯萎状态了。湿度过大就会出现浅褐色的霉状物布满病斑。
2、发病条件
辣椒立枯病是由立枯丝核菌感染引起的，通常病菌是褐色由产生菌核来繁衍后代。其属于腐生细菌，会在病残体或是土中过冬。一般由农家肥和农事操作用具传播，但以雨水灌溉水传播为主。郁闭和高温是主要诱因。
3、防治方式
（1）消毒土壤
育苗床消毒，先将土壤翻晒一周，再用多菌灵兑水细细喷雾。覆土或是其他覆盖设施也要一一消毒，比如覆盖苗的稻草、秸秆、薄膜、育苗盘等。另外要使用恶毒灵进行药剂拌种。
（2）管理措施
施用农家肥必须完全腐熟，苗期提高地温，促进生根。苗床温度不能忽高忽低。连阴转晴时及时通风，避免温湿度过高。苗期可喷施0.1%-0.2%磷酸二氢钾，增强辣椒的抗病能力。发现病株及时拔除，并集中烧毁。
（3）用药
辣椒立枯病发病初期可喷施40%甲基硫菌灵悬浮剂500倍稀释液，或5%井冈霉素水剂1500倍稀释液，或15%恶霉灵水剂450倍稀释液。用药量可根据病情决定，每隔一周喷施1次，连续喷施2次左右，多了易产生药害。
二、辣椒病毒病的防治方法
1、栽培防病
在辣椒定植后，开花结果初期，采取每隔4行种植1行玉米的间作方法。由于玉米植株高大，可起到诱蚜的作用，另外在辣椒盛果期正值炎热夏季，高大的玉米植株还可使辣椒免受烈日的暴晒。
2、选用抗病品种
通常早熟、有辣味的品种较晚熟、无辣味的品种抗病，如常种品种津椒3号、甜杂1号2号、农大40、中椒2号3号等。
3、浸种
种子用清水浸泡3-4小时，放入10%磷酸钠中浸20-30分钟，再用清水冲洗，或用0.1%高锰酸钾浸泡30分钟，再用水冲洗，或干热处理，80度处理24小时，70度处理72小时。
4、加强田间管理
适期早播，不要连作，多施磷、钾肥，勿偏施氮肥。清洁田园，减少菌源，将前茬作物带出田间，集中处理，挖坑深埋。
5、减少污染机会
病毒病多因为蚜虫传播农事操作传播，可采用诱杀蚜虫法防治。
