粪肥使用要彻底腐熟：夏季结合高温闷棚对粪肥做发酵处理，在此期间土壤中的微生物非常活跃，有利于形成土壤团粒结构。或者自然堆沤粪肥，期间可使用生物腐熟剂。经过发酵后，其中的虫卵、杂草种子会死亡。
根据不同土质选择不同粪肥：对于沙性大、严重漏水的土壤，可使用纯鸡粪或纯猪粪，这些粪肥很黏重，能改良此类土质。对于黏性土壤，可使用羊粪、牛粪等富含有机质的粪肥，这样能改善其物理性状。
一、如何合理施用粪肥
1、粪肥使用要彻底腐熟
（1）粪肥腐熟后，分解快有助于植物吸收，同时在60-70℃的高温厌氧环境下，有害虫卵、杂草种子大部分会死亡。
（2）粪肥的腐熟目前有三种常用的方式：
①一是结合高温闷棚进行粪肥腐熟。夏季棚室休闲期长，可结合高温闷棚进行粪肥腐熟，腐熟发酵的过程也是改良土壤的过程。在发酵腐熟过程中，土壤中的微生物很活跃，可以促进土壤团粒结构的形成。
②二是棚外堆闷。有足够的时间可以自然堆沤发酵，而时间较短时可以在堆闷腐熟时使用生物腐熟剂。
③三是使用菌剂快速发酵。常用的有ETS菌群等，能缩短发酵腐熟时间。
2、根据不同土质选择不同粪肥
（1）有些大棚土壤沙性大，漏水漏肥的情况严重，因此粪肥应选择纯鸡粪或纯猪粪，这种粪肥纯度较高，养分含量也高，由于粪质比较黏重，对漏肥漏水的沙土地有良好的改良作用。
（2）黏性土应施用有机质含量高而矿质元素含量少的粪肥，如羊粪、牛粪，或者是含有沙子、稻壳、秸秆的鸡粪、猪粪等，可以改善黏性土壤的物理性状，提高其透水透气能力。这样的粪肥也很适合改良土壤盐渍化板结较为严重的棚室土壤。
3、粪肥使用后要深翻
（1）大量的粪肥集中在地表10~15厘米的土壤当中，虽然与土壤进行了混合，但粪肥仍然比较集中，即使已经腐熟的粪肥，在用量如此之大、翻耕深度较浅的情况下，也会影响根系生长。
（2）所以施用粪肥以后应进行深翻，通常翻耕深度要超过30厘米。
4、注意搭配使用
（1）粪肥中虽然含有的养分，但是总量达不到作物的吸收利用量，所以粪肥与化学肥料配合使用可以降低化学肥料残留对土壤造成的影响，同时确保化学肥料中的养分可以及时被作物吸收利用。
（2）粪肥与生物菌肥搭配使用可以加快粪肥的分解，加快土壤改良的速率。粪肥中的物质可促进生物菌的繁殖，巩固有益菌对根系产生的保护和促生效果。
（3）粪肥对土壤改良有一定的作用，但效果比较慢，所以配合含矿源腐植酸、海藻提取物等多种生物刺激剂的海精灵效果更佳，此外海精灵还能刺激植物野性，促进植物基因表达。
二、粪肥不合理施用危害
1、未腐熟粪肥，特别是禽粪含盐分较重、易使土壤盐化，升高土壤盐浓度，严重时会导致种子不发芽、烧苗、烧根。还会产生有害气体，毒害植物。
2、禽畜粪便中较多病菌、虫卵，杂草种子等，不经高温发酵，非常容易给植物带来不良影响，同时还易引病虫害。
3、部分粪肥因为来源问题，可能微量元素含量超标，甚至是含有重金属、等，会毒害植物，影响农产品。
4、粪肥因杂质较多，纯度偏差极大，含量极不稳定，单一施用时没有办法确保施用养分含量及效果。
三、商品有机肥与粪肥的不同点
1、商品有机肥和粪肥同样可以补充有机质，促进团粒结构的形成。
2、但从生产无公害蔬菜和蔬菜的可持续发展方面来讲，商品有机肥更有优势。这是由于商品有机肥与粪肥有非常多不同之处。
